Margarita Trovato es abogada, graduada de la Facultad de Derecho de la Universidad de Buenos Aires (UBA) con orientación en Derecho Internacional Público (2017), y especialista en Derechos Humanos y Estudios Críticos del Derecho por CLACSO (2018). Realizó también cursos de posgrado en la UBA y en la Universidad de Ginebra.
Entre 2014 y 2021 trabajó en el Centro de Estudios Legales y Sociales (CELS), llevando adelante litigios estratégicos ante tribunales nacionales e internacionales, incidencia e investigación en derechos humanos, principalmente en temas de acceso a la justicia y democratización del sistema de inteligencia. Dio clases en la UBA y actualmente se desempeña como docente de nivel secundario en la materia Formación Ética y Ciudadana. Desde febrero de 2022 se desarrolla como Coordinadora de Educación en Derechos Humanos y Juventud en Amnistía Internacional Argentina.